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杨雪蓉
发布时间:2022-06-21 作者: 浏览次数:4579

学    历

博士

职    称

副教授

所属部门

生物技术系

招生专业

细胞生物学(硕士,计算生物学)

联系方式

E-mail: xryang@sdau.edu.cn

个人简介

杨雪蓉,女,博士,副教授。2007年和2014年先后在四川农业大学获得学士和博士学位;201111月至20135月在美国Iowa State University进行博士联合培养,主要从事分子遗传与生物信息学研究。20151月至201611月到中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所从事博士后研究,利用细胞与分子生物学及计算生物学技术进行RNA可变剪接方面的研究工作。201611月至今在太阳集团娱乐网址7777tyc澳门太阳集团城网址&作物生物学国家重点实验室 HPC高性能集群管理平台工作。2019  12 月至 2020  12 月在美国 University of Nebraska-Lincoln农学系做访问学者。主要从事杂种优势利用、可变剪切与计算生物学方面的研究,主持国家自然科学基金青年项目一项,中国博士后科学基金面上项目一项,同时参与国家自然科学基金面上项目等课题,以第一作者或共同作者在 Plant Biotechnology JournalCommunications BiologyPLoS ONEBMC Plant BiologyGenomicsBMC Genomics等杂志发表SCI文章多篇,担任TAGFrontiers in plant sciencesBMC genomics等期刊审稿人。

教学工作

承担本科生《生物信息学》(双语)课程的教学工作

研究方向


以作物(玉米)为主要研究对象,集合高通量三代长片段测序、单细胞、ATAC、转录组/代谢组/蛋白质等多组学技术手段,同时模拟整合现有统计模型和算法,通过群体遗传学和细胞生物学等交叉学科融合,对玉米杂种优势起源和驯化、籽粒发育细胞水平图层构建和可变剪切生物学功能等领域开展系统的研究和探索。

非常欢迎具有数学、统计和编程能力的同学报考本实验室研究生。


科研项目

1.国家自然科学基金委员会,青年项目,玉米褐色叶脉突变体 Brown Midrib 6 (bm6)的图位克隆和功能解析(32101705),2022 - 2024,主持

2.中国博士后科学基金会,面上项目,CLK1在细胞分裂中的剪接调控功能及其对癌症进程的影响 (2015M571612),2015-2017,主持

3.国家自然科学基金委员会,面上项目, 玉米百粒重主效QTL(Hgw1q1)克隆及分子机理解析(32072009),2021 - 2024,参加

4.国家自然科学基金委员会,面上项目,玉米醇溶蛋白基因染色体重排和拷贝数变化的遗传解析(31771799),2018 - 2021,参加

5.山东省自然科学基金委员会,面上项目:玉米褐色叶中脉突变体基因家族调控网络和品质性状遗传改良(ZR2017MC017),2017-2020,参加

6.太阳集团娱乐网址7777双一流建设优势创新团队:玉米突变体库构建与重要农艺性状基因鉴定及应用(564043),2017-2020,参加






发表论文

1.    Liu H†, Wang Q†, Chen M, Ding Y, Yang X, ...... Lai J, Zhang X* and Huang X*. Genome-wide identification and analysis of heterotic loci in three maize hybrids. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(1):185–194.

2.   Liu H†, Huang Y†, Li X†,……, Yang X, Huang X, Yuan L, An D, Wang W, Holding D.R. and Wu Y*. High frequency DNA rearrangement at qγ27 creates a novel allele for Quality Protein Maize breeding. Communications Biology, 2019, 2: 460.

3.    Liu H#, Ma L#, Yang X#, Zuo T, Zhang L, Zeng X, Peng H, Pan G, Wu Y, Shen Y: Integrative analyses of DNA methylation, mRNA, and small RNA during dedifferentiation of maize embryo. BMC plant biology 2017, 17(1):105. (#co-first)

4.     Wei HH, Liu Y, Wang Y, Lu Q, Yang X, Li J, Wang Z. Engineering Artificial Factors to Specifically Manipulate Alternative Splicing in Human Cells. J. Vis. Exp., 2017, 122.

5.     Yang X#, Koltes JE#, Park CA, Chen D, Reecy JM. Gene co-expression network analysis provides novel insights into myostatin regulation at three different mouse developmental timepoints. PLoS One. 2015, 10(2): e0117607.

6.     Yang X, Yu B, Mao XB, Zheng P, He J, Yu J, He Y, Reecy JM, Chen DW. Lean and obese pig breeds exhibit differences in prenatal gene expression profiles of muscle development. Animal. 2015, 9(1): 28-34.

7.    Liu H#, Yang X#, Liao X#, Zuo T, Qin C, Cao S, Dong L, Zhou H, Zhang Y, Liu S, Shen Y, Lin H, Lübberstedt T, Zhang Z, Pan G. Genome-wide comparative analysis of digital gene expression tag profiles during maize ear development. Genomics. 2015, 106(1): 52-60. (#co-first)

8.     Liu H, Qin C, Chen Z, Zuo T, Yang X, Zhou H, Xu M, Cao S, Shen Y, Lin H, He X, Zhang Y, Li L, Ding H, Lübberstedt T, Zhang Z, Pan G. Identification of miRNAs and their target genes in developing maize ears by combined small RNA and degradome sequencing. BMC genomics2014, 15:25.

9.      Lei H, Yu B, Huang Z, Yang X, Liu Z, Mao X, Tian G, He J, Han G, Chen H, Mao Q, Chen D. Comparative analysis of mesenchymal stem cells from adult mouse adipose, muscle, and fetal muscle. Mol Biol Rep. 2013, 40(2): 885-892.

10.  Lei H, Yu B, Yang X, Liu Z, Huang Z, Mao X, Tian G, He J, Han G, Chen H, Mao Q, Chen D.   Inhibition of adipogenic differentiation by myostatin is alleviated by arginine supplementation in   porcine-muscle-derived mesenchymal stem cells. Sci China Life Sci. 2011, 54(10): 908-916.



  



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